1999年，为了使人进化为“完美的个体”，由NEO（NextEnvironmentOrganization）领导并开始实行BESTMAN计划，但是结果是失败了。试验将尊者进化成了拥有无限再生能力的（Cancer）。不仅如此，作为整个人类社会的敌人，的目的就是消灭整个人类，但是首先他就必须要消灭一直保护着人类的共生免疫体（Betterman）。而当时在场的其他几位幸存着则把存在的消息以一种蛋白质的形式传播出去，并引起人类自毁灭的DNA程式，它所造成的离奇疾病就是，而这种疾病的目的就是召唤出人类的免役体。时间前进到2006年，在这期间，NEO直属机构（ModeWarp）一直致力于病的研究，在一次游乐园的大规模杀人事件调查中，原（HeadDiver）因突然发作而被失控的游乐园机器人杀死。关键时刻，17岁的高中生蒼斧蛍汰在一次不是突发的突发中坐上了覚醒人1号，并打败了由一团电线构成的机器人豆木，但是在巨型出现后，覚醒人却因为（LinkerGel）的使用到达限界而停止了活动。就在蛍汰和火乃紀的生命处于最危急的时刻，出现打倒了敌人事件后蛍汰加入了，驾驶覚醒人调查各种奇怪事件，不时的遭遇了各种奇怪的暂时没有网友评论该影片